Titelaufnahme

Titel
Data models, graph analysis, and information retrieval from biological data / von Raul Fechete
VerfasserFechete, Raul
Begutachter / BegutachterinFreund, Rudolf ; Mayer, Bernd
Erschienen2009
UmfangVI, 83 Bl. : Ill., graph. Darst.
HochschulschriftWien, Techn. Univ., Dipl.-Arb., 2009
Anmerkung
Zsfassung in dt. Sprache
SpracheEnglisch
DokumenttypDiplomarbeit
Schlagwörter (DE)Systembiologie / Omics / Biologische Daten / Graphen / Datenbanken / Kürzeste Pfade
Schlagwörter (EN)systems biology / omics / biological data / graphs / databases / shortest paths
URNurn:nbn:at:at-ubtuw:1-25993 Persistent Identifier (URN)
Zugriffsbeschränkung
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Data models, graph analysis, and information retrieval from biological data [3.54 mb]
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Klassifikation
Zusammenfassung (Englisch)

This thesis introduces a possible approach to information extraction from a biological context, by building a molecular dependency network.

Our aim is to optimize hypothesis generation for laboratory experiments, with the ultimate goal of disease-associated biomarker and drug target discovery.

We present a three-stage method involving data warehousing, scientific information consolidation and analysis. Further, we investigate the method by running tests using specific datasets from B-cell lymphoma and renal transplant ischemia reperfusion injury.